El Centro de Estudios en Salud (CES) tiene como objetivos los siguientes: realizar estudios multidisciplinarios de campo y laboratorio sobre enfermedades importantes que afectan a seres humanos en las siguientes áreas prioritarias: malaria/dengue, enfermedad de Chagas, leishmaniasis,  enfermedades transmitidas por alimentos y agua (agua y saneamiento), enfermedades respiratorias agudas, y VIH/SIDA.  Asimismo, el CES busca mejorar la capacitación de estudiantes y profesionales en el campo de la salud para la aplicación de métodos de investigación básica y aplicada y reforzar la capacidad institucional en salud pública; también se ofrece el servicio de análisis microbiológico de agua.  Además, el CES es la contrapartida institucional para todas las actividades llevadas a cabo en colaboración con la Unidad de Investigación y Adiestramiento en Entomología Médica (Medical Entomology Research and Training Unit/Guatemala – MERTU/G), una estación de investigación de campo de la División de Enfermedades Parasitarias, Centros Nacionales para Enfermedades Infecciosas, Centros de Control y Prevención de Enfermedades (CDC, por sus siglas en inglés), Estados Unidos. 

Capacidad de Laboratorio para Investigación, Adiestramiento y Vigilancia

·         Laboratorio de Agua y Alimentos

·         Laboratorio de Bacteriología

·         Laboratorio de Parasitología

·         Laboratorio de Enfermedades Transmitidas por Vectores

·         Laboratorio de Biología Molecular  

·         Telediagnóstico

·         Laboratorio BSL3  (en construcción)

 Sistemas de Información Disponibles para Investigación, Adiestramiento y Vigilancia

·         Centro de manejo de Datos

·         Sistema de Información Geográfica y Análisis Espacial

·         Mantenimiento de Datos

·         Sistema de Información Geográfica Nacional (SIGNA)