La ingeniería en biotecnología industrial, a partir de sistemas vivientes o sus derivados, combina las operaciones unitarias con la bioquímica y microbiología para realizar procesos y obtener productos a escala industrial.

En muchos casos, se requiere de procesos innovadores e investigación, el desarrollo, diseño de procesos y equipos, y la evaluación de la rentabilidad son vitales.

Todos los procesos y tecnología que utiliza el ingeniero en Biotecnología Industrial deben tomar en cuenta el uso eficiente de todos los recursos y velar por el cuidado del ambiente.